
姓名:孙婷婷
职称:教授
办公室:A4-505-1
E-mail:tingtingsun@zust.edu.cn
主要研究方向:蛋白质的构象及其动力学、RNA分子的折叠动力学、机器学习预测生物大分子结构与功能
个人简介:博士,教授,博士生导师。浙江大学物理学专业博士毕业,密苏里大学哥伦比亚分校访问者。2007年3月至2018年6月在浙江工商大学工作,2013年3月至2014年3月在美国密苏里大学哥伦比亚分校研究访问,2018年6月至今在浙江科技大学工作。主持国家自然科学基金项目1项,浙江省自然科学基金2项,重大企业横向课题3项,教育部产学合作协同育人项目1项。主持浙江省一流课程2项。发表学术论文30多篇。2014年开始指导研究生,先后在浙江工商大学、浙江科技大学招收和培养的毕业研究生16名。
科研论文(近五年):
1. Tingting Sun*,Wentao Xia, Jiasai Shu, Chunjiang Sang, Mei Feng, Xiaojun Xu, Advances and Challenges in Machine Learning for RNA-Small Molecule Interaction Modeling: Review. Journal of Chemical Theory and Computation, 2025, 21(18), 8615-8633.
2. Chunjiang Sang, Jiasai Shu, Kang Wang, Wentao Xia, Yan Wang, Tingting Sun*, Xiaojun Xu, The prediction of RNA-small molecule binding sites in RNA structures based on geometric deep learning. International Journal of Biological Macromolecules, 2025, 310, 143308.
3. Chunjiang Sang, Jiasai Shu, Wentao Xia, Kang Wang, Xiaojun Xu, Tingting Sun*, Cotranscriptional folding kinetics of Cbe pfl riboswitch. Chemical Physics Letters, 2025, 868, 142066.
4. Xinyi Zhao, Siqi Sun, Ning Zhou, Xiaojun Xu, Yan Wang, Tingting Sun*,Mesoscopic Simulation on Self-assembly of Diphenylalanine-based Analogue with Ethylenediamine Linker. Chinese Journal of Polymer Science, 2025, 43, 666–676.
5. Xinyi Zhao, Kang Wang, Lunwu Zhu, Yan Wang, Tingting Sun*, Influence of Mg2+ and THF on THF-II riboswitch based on molecular dynamics simulations. Chemical Physics Letters, 2025, 860, 141815.
6. Wentao Xia, Jiasai Shu, Chunjiang Sang, Kang Wang, Yan Wang, Tingting Sun*, Xiaojun Xu, The prediction of RNA-small-molecule ligand binding affinity based on geometric deep learning. Computaional Biology and Chemistry, 2025, 115, 108367.
7. Wang Kang, Yin Zuode, Sang Chunjiang, Xia Wentao, Wang Yan, Sun Tingting*, Xu Xiaojun, Geometric deep learning for the prediction of magnesium-binding sites in RNA structures, International Journal of Biological Macromolecules,2024, 262, 130150.
8. Zuo Changsheng, Wang Kang; Sun Lizhen; Sun Tingting*, Molecular Chaperone-Dependent Polymer Translocation through Nanopores:The Effects of Chaperone Concentration and Chaperone-Polymer Interaction, Chinese Journal of Polymer Science, 2023, 42: 1-8.
9. Wang Kang, He Yunan, Shen Yu, Wang Yan, Xu Xiaojun, Song Xiaohui, Sun Tingting*, Effect of pausing on the cotranscriptional folding kinetics of RNAs. International Journal of Biological Macromolecules, 2022, 221: 1345-1355.
10. He Yunan, Wang Kang, Shen Yu, Xu Xiaojun, Wang Yan, Li Xingao, Sun Tingting*, Molecular dynamics simulation on the Thermosinus carboxydivorans pfl ZTP riboswitch by ligand binding. Biochemical and Biophysical Research Communications, 2022, 627: 184-190.
科研项目:
1. 基于机器学习的RNA复合结构和性质计算平台开发,企业横向课题,39万,2022.11-2023.11,1/1,主持
2. 大分子拥挤环境中脂肪酸酐自催化水解异常链长依赖效应的热力学机制,国家自然科学基金面上项目,65万,2017.1-2020.12,2/7,参与
3. 核糖开关共转录过程中的折叠动力学研究,浙江省自然科学基金面上项目,8万,2017.1-2019.12, 1/7,主持
4. 分子拥挤环境下蛋白质的输运过程研究, 浙江省自然科学基金面上项目,8万,2012.1-2014.12, 1/7,主持
5. 蛋白质传输过程中构象及其动力学性质的研究, 国家自然科学基金青年基金项目,19万,2010.1-2012.12, 1/7,主持
6. 蛋白质在分子伴侣调控下折叠过程的动力学行为研究,浙江省自然科学基金面上项目,8万,2011.1-2013.12, 2/7,参与
科研成果奖:
1. 浙江省高等学校科研成果三等奖,高分子侧基极性等对链尺寸和偶极矩及温度特性的影响,2009年,第三
教研项目:
1. 浙江省国际化线上线下混合式一流本科课程,University Physics,2021.9,主持
2. 浙江省国际化线上一流本科课程,大学物理实验B,2022.10,主持
3. 浙江省研究生教学改革项目,2025年,主持